Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBP50607 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBP50607 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBP50607 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBP50607 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TUBP50607 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TUBP50607 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TUBP50607 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
TUBP50607 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TUBP50607 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TUBP50607 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TUBP50607 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TUBP50607 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBP50607 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBP50607 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBP50607 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBP50607 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBP50607 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBP50607 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBP50607 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBP50607 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBP50607 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBP50607 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBP50607 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBP50607 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBP50607 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBP50607 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBP50607 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBP50607 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TUBP50607 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TUBP50607 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TUBP50607 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBP50607 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBP50607 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBP50607 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBP50607 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBP50607 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBP50607 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBP50607 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBP50607 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBP50607 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBP50607 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBP50607 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBP50607 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBP50607 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBP50607 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBP50607 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBP50607 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBP50607 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBP50607 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBP50607 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBP50607 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBP50607 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBP50607 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBP50607 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBP50607 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBP50607 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBP50607 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBP50607 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBP50607 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBP50607 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBP50607 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBP50607 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBP50607 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBP50607 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
TUBP50607 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
TUBP50607 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBP50607 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBP50607 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBP50607 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBP50607 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBP50607 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBP50607 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBP50607 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBP50607 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBP50607 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBP50607 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBP50607 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBP50607 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBP50607 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBP50607 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBP50607 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBP50607 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBP50607 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBP50607 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBP50607 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBP50607 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBP50607 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBP50607 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBP50607 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBP50607 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBP50607 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBP50607 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBP50607 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBP50607 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBP50607 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBP50607 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBP50607 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBP50607 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBP50607 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms