Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLK2P49760 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLK2P49760 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLK2P49760 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLK2P49760 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLK2P49760 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLK2P49760 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CLK2P49760 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLK2P49760 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLK2P49760 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLK2P49760 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLK2P49760 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLK2P49760 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLK2P49760 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLK2P49760 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CLK2P49760 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLK2P49760 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLK2P49760 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLK2P49760 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLK2P49760 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLK2P49760 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLK2P49760 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLK2P49760 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLK2P49760 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLK2P49760 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CLK2P49760 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CLK2P49760 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLK2P49760 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLK2P49760 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLK2P49760 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLK2P49760 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLK2P49760 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLK2P49760 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLK2P49760 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLK2P49760 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLK2P49760 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLK2P49760 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLK2P49760 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLK2P49760 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLK2P49760 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLK2P49760 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLK2P49760 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLK2P49760 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLK2P49760 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLK2P49760 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLK2P49760 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CLK2P49760 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLK2P49760 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLK2P49760 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLK2P49760 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLK2P49760 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLK2P49760 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLK2P49760 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CLK2P49760 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLK2P49760 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLK2P49760 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLK2P49760 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLK2P49760 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLK2P49760 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLK2P49760 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLK2P49760 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLK2P49760 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLK2P49760 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLK2P49760 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLK2P49760 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLK2P49760 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLK2P49760 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLK2P49760 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLK2P49760 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLK2P49760 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLK2P49760 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLK2P49760 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLK2P49760 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLK2P49760 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CLK2P49760 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLK2P49760 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLK2P49760 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLK2P49760 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLK2P49760 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLK2P49760 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLK2P49760 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLK2P49760 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLK2P49760 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLK2P49760 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLK2P49760 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLK2P49760 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLK2P49760 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLK2P49760 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLK2P49760 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLK2P49760 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLK2P49760 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLK2P49760 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLK2P49760 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CLK2P49760 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLK2P49760 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLK2P49760 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CLK2P49760 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLK2P49760 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLK2P49760 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLK2P49760 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms