Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CENPFP49454 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CENPFP49454 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CENPFP49454 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CENPFP49454 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CENPFP49454 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CENPFP49454 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CENPFP49454 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CENPFP49454 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CENPFP49454 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CENPFP49454 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CENPFP49454 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPFP49454 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPFP49454 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPFP49454 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CENPFP49454 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPFP49454 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPFP49454 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPFP49454 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CENPFP49454 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CENPFP49454 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CENPFP49454 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CENPFP49454 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPFP49454 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPFP49454 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CENPFP49454 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CENPFP49454 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CENPFP49454 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CENPFP49454 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CENPFP49454 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CENPFP49454 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CENPFP49454 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CENPFP49454 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CENPFP49454 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CENPFP49454 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CENPFP49454 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CENPFP49454 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CENPFP49454 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CENPFP49454 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CENPFP49454 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CENPFP49454 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CENPFP49454 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CENPFP49454 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPFP49454 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPFP49454 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPFP49454 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPFP49454 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CENPFP49454 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CENPFP49454 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CENPFP49454 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CENPFP49454 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CENPFP49454 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CENPFP49454 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CENPFP49454 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CENPFP49454 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CENPFP49454 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CENPFP49454 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CENPFP49454 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CENPFP49454 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CENPFP49454 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CENPFP49454 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CENPFP49454 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CENPFP49454 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CENPFP49454 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CENPFP49454 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CENPFP49454 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CENPFP49454 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CENPFP49454 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CENPFP49454 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CENPFP49454 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CENPFP49454 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CENPFP49454 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPFP49454 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPFP49454 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPFP49454 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPFP49454 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPFP49454 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CENPFP49454 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CENPFP49454 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CENPFP49454 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CENPFP49454 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CENPFP49454 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CENPFP49454 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CENPFP49454 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPFP49454 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPFP49454 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPFP49454 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPFP49454 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPFP49454 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPFP49454 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPFP49454 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CENPFP49454 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CENPFP49454 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CENPFP49454 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CENPFP49454 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CENPFP49454 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CENPFP49454 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CENPFP49454 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CENPFP49454 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CENPFP49454 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
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