Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGM4P49221 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGM4P49221 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGM4P49221 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGM4P49221 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGM4P49221 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGM4P49221 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGM4P49221 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGM4P49221 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGM4P49221 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGM4P49221 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TGM4P49221 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGM4P49221 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGM4P49221 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGM4P49221 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGM4P49221 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGM4P49221 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGM4P49221 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TGM4P49221 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGM4P49221 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGM4P49221 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TGM4P49221 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TGM4P49221 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TGM4P49221 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TGM4P49221 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TGM4P49221 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGM4P49221 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TGM4P49221 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGM4P49221 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGM4P49221 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TGM4P49221 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TGM4P49221 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGM4P49221 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGM4P49221 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGM4P49221 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGM4P49221 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGM4P49221 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGM4P49221 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGM4P49221 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGM4P49221 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TGM4P49221 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGM4P49221 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGM4P49221 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGM4P49221 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGM4P49221 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGM4P49221 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGM4P49221 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TGM4P49221 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGM4P49221 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGM4P49221 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGM4P49221 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGM4P49221 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGM4P49221 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGM4P49221 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGM4P49221 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGM4P49221 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TGM4P49221 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TGM4P49221 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TGM4P49221 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TGM4P49221 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGM4P49221 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGM4P49221 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGM4P49221 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGM4P49221 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TGM4P49221 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGM4P49221 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGM4P49221 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGM4P49221 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGM4P49221 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGM4P49221 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGM4P49221 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TGM4P49221 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGM4P49221 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TGM4P49221 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGM4P49221 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGM4P49221 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGM4P49221 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGM4P49221 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGM4P49221 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGM4P49221 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGM4P49221 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGM4P49221 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGM4P49221 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGM4P49221 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGM4P49221 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGM4P49221 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGM4P49221 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGM4P49221 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGM4P49221 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGM4P49221 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TGM4P49221 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGM4P49221 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGM4P49221 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGM4P49221 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TGM4P49221 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TGM4P49221 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TGM4P49221 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TGM4P49221 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TGM4P49221 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TGM4P49221 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms