Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LHX1P48742 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LHX1P48742 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LHX1P48742 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LHX1P48742 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LHX1P48742 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LHX1P48742 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LHX1P48742 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LHX1P48742 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LHX1P48742 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LHX1P48742 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LHX1P48742 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LHX1P48742 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LHX1P48742 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LHX1P48742 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LHX1P48742 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LHX1P48742 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LHX1P48742 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LHX1P48742 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LHX1P48742 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LHX1P48742 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LHX1P48742 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LHX1P48742 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LHX1P48742 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LHX1P48742 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LHX1P48742 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LHX1P48742 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LHX1P48742 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LHX1P48742 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LHX1P48742 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LHX1P48742 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LHX1P48742 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LHX1P48742 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
LHX1P48742 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LHX1P48742 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LHX1P48742 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LHX1P48742 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LHX1P48742 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LHX1P48742 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LHX1P48742 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LHX1P48742 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LHX1P48742 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LHX1P48742 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LHX1P48742 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LHX1P48742 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LHX1P48742 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LHX1P48742 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LHX1P48742 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LHX1P48742 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LHX1P48742 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LHX1P48742 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LHX1P48742 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LHX1P48742 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LHX1P48742 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LHX1P48742 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LHX1P48742 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LHX1P48742 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LHX1P48742 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LHX1P48742 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LHX1P48742 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LHX1P48742 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LHX1P48742 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LHX1P48742 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LHX1P48742 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LHX1P48742 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LHX1P48742 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LHX1P48742 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LHX1P48742 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LHX1P48742 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LHX1P48742 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
LHX1P48742 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LHX1P48742 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LHX1P48742 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LHX1P48742 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LHX1P48742 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LHX1P48742 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LHX1P48742 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LHX1P48742 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LHX1P48742 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LHX1P48742 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LHX1P48742 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LHX1P48742 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LHX1P48742 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LHX1P48742 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LHX1P48742 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LHX1P48742 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LHX1P48742 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LHX1P48742 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LHX1P48742 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LHX1P48742 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LHX1P48742 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LHX1P48742 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LHX1P48742 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LHX1P48742 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LHX1P48742 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LHX1P48742 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LHX1P48742 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LHX1P48742 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LHX1P48742 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LHX1P48742 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms