Protein–RNA interactions for Protein: P48664

SLC1A6, Excitatory amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A6P48664 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A6P48664 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A6P48664 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A6P48664 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A6P48664 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A6P48664 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A6P48664 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A6P48664 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A6P48664 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A6P48664 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A6P48664 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A6P48664 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A6P48664 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC1A6P48664 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC1A6P48664 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC1A6P48664 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC1A6P48664 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC1A6P48664 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC1A6P48664 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC1A6P48664 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC1A6P48664 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A6P48664 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A6P48664 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A6P48664 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A6P48664 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC1A6P48664 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A6P48664 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A6P48664 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A6P48664 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A6P48664 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC1A6P48664 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC1A6P48664 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC1A6P48664 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC1A6P48664 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC1A6P48664 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC1A6P48664 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC1A6P48664 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC1A6P48664 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC1A6P48664 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC1A6P48664 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC1A6P48664 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC1A6P48664 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC1A6P48664 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC1A6P48664 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A6P48664 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A6P48664 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A6P48664 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A6P48664 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A6P48664 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A6P48664 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A6P48664 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A6P48664 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A6P48664 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A6P48664 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A6P48664 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A6P48664 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A6P48664 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC1A6P48664 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC1A6P48664 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC1A6P48664 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC1A6P48664 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC1A6P48664 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC1A6P48664 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC1A6P48664 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC1A6P48664 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC1A6P48664 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC1A6P48664 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC1A6P48664 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A6P48664 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A6P48664 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A6P48664 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A6P48664 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A6P48664 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A6P48664 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A6P48664 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A6P48664 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A6P48664 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A6P48664 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A6P48664 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A6P48664 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A6P48664 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A6P48664 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A6P48664 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A6P48664 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A6P48664 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A6P48664 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A6P48664 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A6P48664 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A6P48664 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A6P48664 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A6P48664 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A6P48664 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A6P48664 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A6P48664 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A6P48664 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A6P48664 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A6P48664 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC1A6P48664 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC1A6P48664 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC1A6P48664 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms