Protein–RNA interactions for Protein: P48547

KCNC1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC1P48547 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNC1P48547 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCNC1P48547 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNC1P48547 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNC1P48547 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNC1P48547 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNC1P48547 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNC1P48547 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNC1P48547 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNC1P48547 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNC1P48547 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNC1P48547 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNC1P48547 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNC1P48547 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNC1P48547 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNC1P48547 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNC1P48547 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNC1P48547 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNC1P48547 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNC1P48547 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNC1P48547 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNC1P48547 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNC1P48547 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNC1P48547 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNC1P48547 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNC1P48547 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNC1P48547 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNC1P48547 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNC1P48547 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNC1P48547 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNC1P48547 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNC1P48547 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNC1P48547 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNC1P48547 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNC1P48547 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
KCNC1P48547 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms