Protein–RNA interactions for Protein: P48066

SLC6A11, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A11P48066 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC6A11P48066 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC6A11P48066 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC6A11P48066 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC6A11P48066 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC6A11P48066 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC6A11P48066 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC6A11P48066 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC6A11P48066 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC6A11P48066 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC6A11P48066 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC6A11P48066 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC6A11P48066 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC6A11P48066 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC6A11P48066 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC6A11P48066 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC6A11P48066 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC6A11P48066 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC6A11P48066 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC6A11P48066 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC6A11P48066 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC6A11P48066 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC6A11P48066 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC6A11P48066 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC6A11P48066 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC6A11P48066 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC6A11P48066 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC6A11P48066 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC6A11P48066 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC6A11P48066 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC6A11P48066 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC6A11P48066 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC6A11P48066 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC6A11P48066 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC6A11P48066 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC6A11P48066 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC6A11P48066 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC6A11P48066 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC6A11P48066 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC6A11P48066 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC6A11P48066 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC6A11P48066 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC6A11P48066 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC6A11P48066 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC6A11P48066 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC6A11P48066 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC6A11P48066 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC6A11P48066 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC6A11P48066 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC6A11P48066 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC6A11P48066 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC6A11P48066 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC6A11P48066 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC6A11P48066 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC6A11P48066 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC6A11P48066 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC6A11P48066 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC6A11P48066 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC6A11P48066 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC6A11P48066 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC6A11P48066 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC6A11P48066 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC6A11P48066 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC6A11P48066 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC6A11P48066 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC6A11P48066 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC6A11P48066 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC6A11P48066 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC6A11P48066 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC6A11P48066 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC6A11P48066 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC6A11P48066 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC6A11P48066 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC6A11P48066 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC6A11P48066 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC6A11P48066 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC6A11P48066 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC6A11P48066 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC6A11P48066 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC6A11P48066 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC6A11P48066 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC6A11P48066 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC6A11P48066 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC6A11P48066 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC6A11P48066 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC6A11P48066 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC6A11P48066 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC6A11P48066 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC6A11P48066 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC6A11P48066 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC6A11P48066 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC6A11P48066 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC6A11P48066 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC6A11P48066 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC6A11P48066 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC6A11P48066 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC6A11P48066 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC6A11P48066 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC6A11P48066 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC6A11P48066 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms