Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIA4P48058 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIA4P48058 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIA4P48058 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIA4P48058 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIA4P48058 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIA4P48058 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIA4P48058 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIA4P48058 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIA4P48058 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIA4P48058 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIA4P48058 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIA4P48058 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIA4P48058 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIA4P48058 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIA4P48058 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIA4P48058 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIA4P48058 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIA4P48058 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIA4P48058 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIA4P48058 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIA4P48058 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIA4P48058 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIA4P48058 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIA4P48058 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIA4P48058 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIA4P48058 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIA4P48058 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIA4P48058 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIA4P48058 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIA4P48058 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIA4P48058 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIA4P48058 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIA4P48058 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIA4P48058 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIA4P48058 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIA4P48058 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIA4P48058 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIA4P48058 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIA4P48058 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIA4P48058 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIA4P48058 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIA4P48058 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIA4P48058 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIA4P48058 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIA4P48058 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIA4P48058 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIA4P48058 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIA4P48058 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIA4P48058 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIA4P48058 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIA4P48058 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIA4P48058 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIA4P48058 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIA4P48058 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIA4P48058 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIA4P48058 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIA4P48058 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIA4P48058 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIA4P48058 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIA4P48058 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIA4P48058 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIA4P48058 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIA4P48058 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIA4P48058 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIA4P48058 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIA4P48058 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIA4P48058 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GRIA4P48058 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIA4P48058 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIA4P48058 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIA4P48058 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIA4P48058 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIA4P48058 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIA4P48058 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIA4P48058 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIA4P48058 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIA4P48058 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIA4P48058 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIA4P48058 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIA4P48058 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIA4P48058 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIA4P48058 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIA4P48058 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIA4P48058 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIA4P48058 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIA4P48058 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIA4P48058 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIA4P48058 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIA4P48058 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIA4P48058 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIA4P48058 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIA4P48058 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIA4P48058 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIA4P48058 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIA4P48058 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIA4P48058 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIA4P48058 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIA4P48058 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIA4P48058 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms