Protein–RNA interactions for Protein: P48039

MTNR1A, Melatonin receptor type 1A, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTNR1AP48039 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTNR1AP48039 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTNR1AP48039 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTNR1AP48039 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTNR1AP48039 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MTNR1AP48039 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTNR1AP48039 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTNR1AP48039 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTNR1AP48039 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTNR1AP48039 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTNR1AP48039 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTNR1AP48039 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTNR1AP48039 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTNR1AP48039 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTNR1AP48039 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTNR1AP48039 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTNR1AP48039 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTNR1AP48039 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTNR1AP48039 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTNR1AP48039 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTNR1AP48039 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTNR1AP48039 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTNR1AP48039 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTNR1AP48039 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MTNR1AP48039 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTNR1AP48039 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTNR1AP48039 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MTNR1AP48039 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTNR1AP48039 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTNR1AP48039 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTNR1AP48039 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTNR1AP48039 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTNR1AP48039 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTNR1AP48039 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTNR1AP48039 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTNR1AP48039 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTNR1AP48039 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTNR1AP48039 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MTNR1AP48039 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTNR1AP48039 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTNR1AP48039 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTNR1AP48039 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTNR1AP48039 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTNR1AP48039 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTNR1AP48039 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTNR1AP48039 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTNR1AP48039 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTNR1AP48039 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTNR1AP48039 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTNR1AP48039 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTNR1AP48039 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTNR1AP48039 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTNR1AP48039 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms