Protein–RNA interactions for Protein: P48029

SLC6A8, Sodium- and chloride-dependent creatine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A8P48029 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A8P48029 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A8P48029 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A8P48029 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A8P48029 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A8P48029 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A8P48029 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A8P48029 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A8P48029 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A8P48029 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A8P48029 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A8P48029 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A8P48029 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A8P48029 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A8P48029 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A8P48029 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A8P48029 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A8P48029 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A8P48029 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A8P48029 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A8P48029 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A8P48029 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A8P48029 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A8P48029 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A8P48029 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A8P48029 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A8P48029 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A8P48029 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A8P48029 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A8P48029 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A8P48029 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A8P48029 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A8P48029 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A8P48029 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC6A8P48029 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC6A8P48029 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC6A8P48029 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A8P48029 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A8P48029 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A8P48029 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A8P48029 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A8P48029 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A8P48029 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A8P48029 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A8P48029 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A8P48029 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A8P48029 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A8P48029 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A8P48029 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A8P48029 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC6A8P48029 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC6A8P48029 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC6A8P48029 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC6A8P48029 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A8P48029 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A8P48029 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A8P48029 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A8P48029 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A8P48029 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A8P48029 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A8P48029 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A8P48029 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A8P48029 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A8P48029 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A8P48029 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A8P48029 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A8P48029 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A8P48029 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A8P48029 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A8P48029 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A8P48029 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A8P48029 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A8P48029 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A8P48029 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A8P48029 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A8P48029 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A8P48029 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A8P48029 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A8P48029 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A8P48029 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A8P48029 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A8P48029 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A8P48029 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A8P48029 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A8P48029 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A8P48029 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A8P48029 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A8P48029 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A8P48029 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A8P48029 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A8P48029 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A8P48029 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A8P48029 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A8P48029 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A8P48029 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A8P48029 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A8P48029 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A8P48029 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A8P48029 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A8P48029 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms