Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTGIRP43119 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTGIRP43119 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTGIRP43119 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTGIRP43119 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTGIRP43119 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTGIRP43119 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTGIRP43119 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTGIRP43119 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTGIRP43119 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTGIRP43119 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTGIRP43119 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTGIRP43119 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PTGIRP43119 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTGIRP43119 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTGIRP43119 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTGIRP43119 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTGIRP43119 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PTGIRP43119 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTGIRP43119 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTGIRP43119 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTGIRP43119 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGIRP43119 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGIRP43119 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGIRP43119 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGIRP43119 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGIRP43119 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGIRP43119 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGIRP43119 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGIRP43119 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTGIRP43119 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTGIRP43119 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTGIRP43119 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTGIRP43119 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTGIRP43119 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTGIRP43119 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTGIRP43119 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTGIRP43119 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTGIRP43119 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTGIRP43119 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTGIRP43119 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTGIRP43119 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGIRP43119 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGIRP43119 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGIRP43119 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGIRP43119 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGIRP43119 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGIRP43119 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGIRP43119 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTGIRP43119 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
PTGIRP43119 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTGIRP43119 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTGIRP43119 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTGIRP43119 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTGIRP43119 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTGIRP43119 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGIRP43119 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGIRP43119 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGIRP43119 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGIRP43119 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTGIRP43119 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTGIRP43119 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTGIRP43119 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTGIRP43119 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTGIRP43119 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTGIRP43119 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTGIRP43119 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTGIRP43119 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGIRP43119 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGIRP43119 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGIRP43119 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGIRP43119 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGIRP43119 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGIRP43119 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGIRP43119 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGIRP43119 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGIRP43119 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGIRP43119 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTGIRP43119 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTGIRP43119 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTGIRP43119 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTGIRP43119 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTGIRP43119 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PTGIRP43119 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTGIRP43119 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTGIRP43119 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGIRP43119 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGIRP43119 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGIRP43119 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTGIRP43119 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTGIRP43119 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTGIRP43119 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTGIRP43119 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTGIRP43119 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTGIRP43119 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTGIRP43119 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTGIRP43119 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTGIRP43119 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTGIRP43119 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGIRP43119 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms