Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTGER3P43115 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGER3P43115 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGER3P43115 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGER3P43115 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGER3P43115 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGER3P43115 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGER3P43115 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGER3P43115 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGER3P43115 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGER3P43115 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGER3P43115 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGER3P43115 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGER3P43115 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGER3P43115 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGER3P43115 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGER3P43115 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGER3P43115 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGER3P43115 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGER3P43115 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGER3P43115 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGER3P43115 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGER3P43115 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGER3P43115 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGER3P43115 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGER3P43115 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGER3P43115 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGER3P43115 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGER3P43115 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGER3P43115 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGER3P43115 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGER3P43115 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGER3P43115 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGER3P43115 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGER3P43115 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGER3P43115 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTGER3P43115 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTGER3P43115 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTGER3P43115 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTGER3P43115 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTGER3P43115 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTGER3P43115 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PTGER3P43115 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTGER3P43115 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTGER3P43115 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTGER3P43115 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PTGER3P43115 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTGER3P43115 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTGER3P43115 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTGER3P43115 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTGER3P43115 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTGER3P43115 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTGER3P43115 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTGER3P43115 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTGER3P43115 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTGER3P43115 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTGER3P43115 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTGER3P43115 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTGER3P43115 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTGER3P43115 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTGER3P43115 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTGER3P43115 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTGER3P43115 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTGER3P43115 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTGER3P43115 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTGER3P43115 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTGER3P43115 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTGER3P43115 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTGER3P43115 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTGER3P43115 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTGER3P43115 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTGER3P43115 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTGER3P43115 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTGER3P43115 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTGER3P43115 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTGER3P43115 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTGER3P43115 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGER3P43115 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGER3P43115 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGER3P43115 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGER3P43115 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGER3P43115 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGER3P43115 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGER3P43115 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGER3P43115 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGER3P43115 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGER3P43115 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGER3P43115 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGER3P43115 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGER3P43115 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTGER3P43115 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTGER3P43115 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTGER3P43115 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTGER3P43115 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTGER3P43115 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTGER3P43115 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTGER3P43115 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTGER3P43115 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTGER3P43115 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTGER3P43115 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms