Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
TMPOP42166 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TMPOP42166 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TMPOP42166 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TMPOP42166 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TMPOP42166 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TMPOP42166 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TMPOP42166 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TMPOP42166 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
TMPOP42166 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TMPOP42166 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TMPOP42166 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TMPOP42166 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
TMPOP42166 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TMPOP42166 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TMPOP42166 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TMPOP42166 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TMPOP42166 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TMPOP42166 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TMPOP42166 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TMPOP42166 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TMPOP42166 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TMPOP42166 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TMPOP42166 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TMPOP42166 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
TMPOP42166 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TMPOP42166 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TMPOP42166 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TMPOP42166 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TMPOP42166 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TMPOP42166 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
TMPOP42166 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TMPOP42166 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TMPOP42166 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TMPOP42166 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TMPOP42166 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TMPOP42166 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TMPOP42166 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TMPOP42166 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TMPOP42166 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TMPOP42166 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TMPOP42166 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TMPOP42166 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TMPOP42166 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TMPOP42166 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TMPOP42166 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TMPOP42166 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TMPOP42166 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TMPOP42166 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TMPOP42166 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TMPOP42166 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
TMPOP42166 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
TMPOP42166 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
TMPOP42166 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
TMPOP42166 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
TMPOP42166 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
TMPOP42166 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TMPOP42166 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TMPOP42166 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
TMPOP42166 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TMPOP42166 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TMPOP42166 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TMPOP42166 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TMPOP42166 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TMPOP42166 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TMPOP42166 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TMPOP42166 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TMPOP42166 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TMPOP42166 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TMPOP42166 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TMPOP42166 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TMPOP42166 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TMPOP42166 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TMPOP42166 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TMPOP42166 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TMPOP42166 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TMPOP42166 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TMPOP42166 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TMPOP42166 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TMPOP42166 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
TMPOP42166 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
TMPOP42166 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TMPOP42166 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TMPOP42166 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TMPOP42166 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TMPOP42166 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TMPOP42166 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TMPOP42166 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TMPOP42166 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TMPOP42166 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TMPOP42166 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TMPOP42166 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TMPOP42166 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TMPOP42166 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TMPOP42166 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TMPOP42166 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TMPOP42166 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TMPOP42166 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TMPOP42166 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TMPOP42166 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms