Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARL4AP40617 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARL4AP40617 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARL4AP40617 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARL4AP40617 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ARL4AP40617 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARL4AP40617 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARL4AP40617 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARL4AP40617 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARL4AP40617 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARL4AP40617 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARL4AP40617 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARL4AP40617 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARL4AP40617 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARL4AP40617 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARL4AP40617 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARL4AP40617 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARL4AP40617 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARL4AP40617 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARL4AP40617 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARL4AP40617 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARL4AP40617 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARL4AP40617 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARL4AP40617 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ARL4AP40617 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARL4AP40617 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARL4AP40617 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARL4AP40617 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARL4AP40617 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARL4AP40617 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARL4AP40617 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARL4AP40617 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARL4AP40617 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ARL4AP40617 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARL4AP40617 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARL4AP40617 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARL4AP40617 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARL4AP40617 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARL4AP40617 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARL4AP40617 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARL4AP40617 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARL4AP40617 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARL4AP40617 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARL4AP40617 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARL4AP40617 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ARL4AP40617 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARL4AP40617 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARL4AP40617 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARL4AP40617 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARL4AP40617 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARL4AP40617 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARL4AP40617 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARL4AP40617 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ARL4AP40617 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ARL4AP40617 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARL4AP40617 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARL4AP40617 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARL4AP40617 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARL4AP40617 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARL4AP40617 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARL4AP40617 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARL4AP40617 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARL4AP40617 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARL4AP40617 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ARL4AP40617 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARL4AP40617 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARL4AP40617 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARL4AP40617 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARL4AP40617 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARL4AP40617 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARL4AP40617 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARL4AP40617 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARL4AP40617 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARL4AP40617 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARL4AP40617 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARL4AP40617 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARL4AP40617 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARL4AP40617 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARL4AP40617 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARL4AP40617 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARL4AP40617 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARL4AP40617 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARL4AP40617 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARL4AP40617 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARL4AP40617 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARL4AP40617 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARL4AP40617 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARL4AP40617 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARL4AP40617 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARL4AP40617 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARL4AP40617 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARL4AP40617 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARL4AP40617 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARL4AP40617 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARL4AP40617 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARL4AP40617 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARL4AP40617 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARL4AP40617 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARL4AP40617 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARL4AP40617 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms