Protein–RNA interactions for Protein: P37088

SCNN1A, Amiloride-sensitive sodium channel subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1AP37088 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCNN1AP37088 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCNN1AP37088 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCNN1AP37088 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCNN1AP37088 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCNN1AP37088 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCNN1AP37088 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCNN1AP37088 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCNN1AP37088 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCNN1AP37088 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCNN1AP37088 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCNN1AP37088 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCNN1AP37088 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCNN1AP37088 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCNN1AP37088 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCNN1AP37088 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCNN1AP37088 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCNN1AP37088 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCNN1AP37088 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCNN1AP37088 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCNN1AP37088 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCNN1AP37088 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SCNN1AP37088 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCNN1AP37088 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCNN1AP37088 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCNN1AP37088 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCNN1AP37088 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCNN1AP37088 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCNN1AP37088 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCNN1AP37088 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCNN1AP37088 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCNN1AP37088 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCNN1AP37088 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCNN1AP37088 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCNN1AP37088 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCNN1AP37088 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCNN1AP37088 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCNN1AP37088 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCNN1AP37088 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCNN1AP37088 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCNN1AP37088 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SCNN1AP37088 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCNN1AP37088 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCNN1AP37088 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCNN1AP37088 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SCNN1AP37088 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCNN1AP37088 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCNN1AP37088 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCNN1AP37088 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCNN1AP37088 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCNN1AP37088 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCNN1AP37088 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCNN1AP37088 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCNN1AP37088 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCNN1AP37088 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCNN1AP37088 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCNN1AP37088 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCNN1AP37088 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SCNN1AP37088 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCNN1AP37088 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCNN1AP37088 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCNN1AP37088 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCNN1AP37088 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCNN1AP37088 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCNN1AP37088 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCNN1AP37088 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCNN1AP37088 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCNN1AP37088 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCNN1AP37088 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCNN1AP37088 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCNN1AP37088 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCNN1AP37088 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCNN1AP37088 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCNN1AP37088 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SCNN1AP37088 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCNN1AP37088 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SCNN1AP37088 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCNN1AP37088 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCNN1AP37088 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCNN1AP37088 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCNN1AP37088 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCNN1AP37088 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCNN1AP37088 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCNN1AP37088 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCNN1AP37088 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCNN1AP37088 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCNN1AP37088 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCNN1AP37088 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCNN1AP37088 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCNN1AP37088 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCNN1AP37088 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SCNN1AP37088 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCNN1AP37088 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCNN1AP37088 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCNN1AP37088 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SCNN1AP37088 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCNN1AP37088 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCNN1AP37088 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCNN1AP37088 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCNN1AP37088 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms