Protein–RNA interactions for Protein: P36956

SREBF1, Sterol regulatory element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF1P36956 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SREBF1P36956 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SREBF1P36956 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SREBF1P36956 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SREBF1P36956 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SREBF1P36956 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SREBF1P36956 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SREBF1P36956 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SREBF1P36956 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SREBF1P36956 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SREBF1P36956 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SREBF1P36956 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SREBF1P36956 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SREBF1P36956 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SREBF1P36956 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SREBF1P36956 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SREBF1P36956 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SREBF1P36956 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SREBF1P36956 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SREBF1P36956 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SREBF1P36956 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SREBF1P36956 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SREBF1P36956 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SREBF1P36956 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SREBF1P36956 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SREBF1P36956 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SREBF1P36956 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SREBF1P36956 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SREBF1P36956 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SREBF1P36956 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SREBF1P36956 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SREBF1P36956 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SREBF1P36956 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SREBF1P36956 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SREBF1P36956 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SREBF1P36956 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SREBF1P36956 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SREBF1P36956 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SREBF1P36956 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SREBF1P36956 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SREBF1P36956 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SREBF1P36956 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SREBF1P36956 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SREBF1P36956 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SREBF1P36956 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SREBF1P36956 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SREBF1P36956 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SREBF1P36956 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SREBF1P36956 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SREBF1P36956 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SREBF1P36956 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SREBF1P36956 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SREBF1P36956 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SREBF1P36956 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SREBF1P36956 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SREBF1P36956 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SREBF1P36956 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SREBF1P36956 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
SREBF1P36956 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SREBF1P36956 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SREBF1P36956 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SREBF1P36956 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SREBF1P36956 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SREBF1P36956 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SREBF1P36956 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SREBF1P36956 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SREBF1P36956 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SREBF1P36956 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SREBF1P36956 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SREBF1P36956 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SREBF1P36956 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SREBF1P36956 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SREBF1P36956 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SREBF1P36956 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SREBF1P36956 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SREBF1P36956 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SREBF1P36956 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SREBF1P36956 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SREBF1P36956 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SREBF1P36956 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SREBF1P36956 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SREBF1P36956 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SREBF1P36956 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SREBF1P36956 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SREBF1P36956 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SREBF1P36956 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SREBF1P36956 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SREBF1P36956 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SREBF1P36956 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SREBF1P36956 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SREBF1P36956 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SREBF1P36956 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SREBF1P36956 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SREBF1P36956 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SREBF1P36956 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SREBF1P36956 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms