Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LTBRP36941 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LTBRP36941 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LTBRP36941 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LTBRP36941 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LTBRP36941 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LTBRP36941 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LTBRP36941 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LTBRP36941 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LTBRP36941 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LTBRP36941 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LTBRP36941 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LTBRP36941 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LTBRP36941 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LTBRP36941 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LTBRP36941 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LTBRP36941 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LTBRP36941 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LTBRP36941 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LTBRP36941 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LTBRP36941 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LTBRP36941 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LTBRP36941 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LTBRP36941 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LTBRP36941 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LTBRP36941 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LTBRP36941 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LTBRP36941 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LTBRP36941 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LTBRP36941 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LTBRP36941 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LTBRP36941 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LTBRP36941 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LTBRP36941 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LTBRP36941 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LTBRP36941 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LTBRP36941 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LTBRP36941 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LTBRP36941 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LTBRP36941 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LTBRP36941 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LTBRP36941 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LTBRP36941 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LTBRP36941 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LTBRP36941 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LTBRP36941 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LTBRP36941 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LTBRP36941 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LTBRP36941 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LTBRP36941 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LTBRP36941 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LTBRP36941 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LTBRP36941 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LTBRP36941 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LTBRP36941 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LTBRP36941 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LTBRP36941 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LTBRP36941 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LTBRP36941 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LTBRP36941 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LTBRP36941 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LTBRP36941 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LTBRP36941 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LTBRP36941 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LTBRP36941 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LTBRP36941 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LTBRP36941 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LTBRP36941 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LTBRP36941 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LTBRP36941 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LTBRP36941 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LTBRP36941 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LTBRP36941 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LTBRP36941 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LTBRP36941 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LTBRP36941 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LTBRP36941 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LTBRP36941 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LTBRP36941 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LTBRP36941 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LTBRP36941 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LTBRP36941 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LTBRP36941 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LTBRP36941 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LTBRP36941 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LTBRP36941 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LTBRP36941 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LTBRP36941 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LTBRP36941 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LTBRP36941 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LTBRP36941 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LTBRP36941 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LTBRP36941 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LTBRP36941 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LTBRP36941 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LTBRP36941 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LTBRP36941 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LTBRP36941 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LTBRP36941 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LTBRP36941 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms