Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACVR1BP36896 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACVR1BP36896 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACVR1BP36896 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACVR1BP36896 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACVR1BP36896 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACVR1BP36896 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACVR1BP36896 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACVR1BP36896 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACVR1BP36896 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACVR1BP36896 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACVR1BP36896 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACVR1BP36896 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACVR1BP36896 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACVR1BP36896 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACVR1BP36896 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACVR1BP36896 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACVR1BP36896 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACVR1BP36896 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACVR1BP36896 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACVR1BP36896 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACVR1BP36896 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACVR1BP36896 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACVR1BP36896 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACVR1BP36896 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACVR1BP36896 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACVR1BP36896 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACVR1BP36896 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACVR1BP36896 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACVR1BP36896 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACVR1BP36896 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACVR1BP36896 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACVR1BP36896 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACVR1BP36896 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACVR1BP36896 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACVR1BP36896 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACVR1BP36896 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACVR1BP36896 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACVR1BP36896 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACVR1BP36896 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACVR1BP36896 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACVR1BP36896 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACVR1BP36896 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACVR1BP36896 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACVR1BP36896 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACVR1BP36896 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACVR1BP36896 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ACVR1BP36896 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ACVR1BP36896 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACVR1BP36896 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACVR1BP36896 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACVR1BP36896 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACVR1BP36896 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACVR1BP36896 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACVR1BP36896 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ACVR1BP36896 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACVR1BP36896 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACVR1BP36896 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACVR1BP36896 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACVR1BP36896 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACVR1BP36896 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACVR1BP36896 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACVR1BP36896 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACVR1BP36896 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACVR1BP36896 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACVR1BP36896 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACVR1BP36896 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACVR1BP36896 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACVR1BP36896 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACVR1BP36896 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACVR1BP36896 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACVR1BP36896 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ACVR1BP36896 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACVR1BP36896 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACVR1BP36896 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACVR1BP36896 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACVR1BP36896 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACVR1BP36896 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACVR1BP36896 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACVR1BP36896 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACVR1BP36896 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACVR1BP36896 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACVR1BP36896 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACVR1BP36896 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ACVR1BP36896 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACVR1BP36896 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACVR1BP36896 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACVR1BP36896 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACVR1BP36896 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACVR1BP36896 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACVR1BP36896 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACVR1BP36896 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACVR1BP36896 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACVR1BP36896 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACVR1BP36896 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACVR1BP36896 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACVR1BP36896 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACVR1BP36896 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACVR1BP36896 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACVR1BP36896 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms