Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ARL3P36405 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ARL3P36405 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ARL3P36405 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ARL3P36405 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ARL3P36405 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ARL3P36405 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ARL3P36405 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ARL3P36405 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ARL3P36405 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ARL3P36405 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ARL3P36405 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ARL3P36405 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ARL3P36405 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ARL3P36405 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ARL3P36405 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ARL3P36405 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ARL3P36405 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ARL3P36405 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ARL3P36405 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ARL3P36405 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ARL3P36405 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ARL3P36405 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ARL3P36405 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ARL3P36405 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ARL3P36405 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ARL3P36405 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ARL3P36405 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ARL3P36405 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ARL3P36405 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ARL3P36405 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ARL3P36405 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ARL3P36405 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ARL3P36405 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ARL3P36405 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ARL3P36405 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ARL3P36405 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ARL3P36405 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ARL3P36405 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ARL3P36405 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ARL3P36405 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
ARL3P36405 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
ARL3P36405 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
ARL3P36405 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ARL3P36405 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ARL3P36405 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ARL3P36405 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ARL3P36405 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARL3P36405 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARL3P36405 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARL3P36405 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARL3P36405 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARL3P36405 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARL3P36405 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ARL3P36405 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARL3P36405 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARL3P36405 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARL3P36405 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARL3P36405 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARL3P36405 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARL3P36405 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARL3P36405 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARL3P36405 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARL3P36405 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ARL3P36405 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ARL3P36405 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ARL3P36405 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ARL3P36405 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ARL3P36405 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ARL3P36405 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ARL3P36405 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ARL3P36405 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ARL3P36405 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ARL3P36405 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ARL3P36405 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ARL3P36405 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ARL3P36405 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARL3P36405 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARL3P36405 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARL3P36405 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARL3P36405 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARL3P36405 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARL3P36405 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARL3P36405 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARL3P36405 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARL3P36405 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARL3P36405 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARL3P36405 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARL3P36405 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARL3P36405 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARL3P36405 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARL3P36405 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARL3P36405 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARL3P36405 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARL3P36405 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARL3P36405 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ARL3P36405 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARL3P36405 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARL3P36405 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARL3P36405 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms