Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFTPDP35247 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SFTPDP35247 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFTPDP35247 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPDP35247 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPDP35247 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPDP35247 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPDP35247 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPDP35247 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPDP35247 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFTPDP35247 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFTPDP35247 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFTPDP35247 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFTPDP35247 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFTPDP35247 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFTPDP35247 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFTPDP35247 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SFTPDP35247 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFTPDP35247 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFTPDP35247 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFTPDP35247 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SFTPDP35247 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SFTPDP35247 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFTPDP35247 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFTPDP35247 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFTPDP35247 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFTPDP35247 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFTPDP35247 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFTPDP35247 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SFTPDP35247 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SFTPDP35247 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SFTPDP35247 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SFTPDP35247 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFTPDP35247 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFTPDP35247 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFTPDP35247 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFTPDP35247 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFTPDP35247 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFTPDP35247 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFTPDP35247 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFTPDP35247 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFTPDP35247 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFTPDP35247 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFTPDP35247 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFTPDP35247 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFTPDP35247 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFTPDP35247 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFTPDP35247 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFTPDP35247 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFTPDP35247 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFTPDP35247 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFTPDP35247 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SFTPDP35247 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFTPDP35247 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFTPDP35247 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFTPDP35247 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFTPDP35247 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFTPDP35247 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFTPDP35247 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFTPDP35247 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFTPDP35247 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFTPDP35247 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFTPDP35247 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SFTPDP35247 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFTPDP35247 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFTPDP35247 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFTPDP35247 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFTPDP35247 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFTPDP35247 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFTPDP35247 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFTPDP35247 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFTPDP35247 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFTPDP35247 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFTPDP35247 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFTPDP35247 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFTPDP35247 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SFTPDP35247 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFTPDP35247 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFTPDP35247 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFTPDP35247 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFTPDP35247 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFTPDP35247 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFTPDP35247 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFTPDP35247 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFTPDP35247 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFTPDP35247 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFTPDP35247 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFTPDP35247 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFTPDP35247 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SFTPDP35247 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFTPDP35247 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFTPDP35247 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFTPDP35247 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFTPDP35247 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SFTPDP35247 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms