Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECHS1P30084 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECHS1P30084 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECHS1P30084 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECHS1P30084 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECHS1P30084 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECHS1P30084 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ECHS1P30084 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ECHS1P30084 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ECHS1P30084 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ECHS1P30084 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ECHS1P30084 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ECHS1P30084 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECHS1P30084 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECHS1P30084 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECHS1P30084 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECHS1P30084 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECHS1P30084 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECHS1P30084 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECHS1P30084 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECHS1P30084 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECHS1P30084 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ECHS1P30084 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ECHS1P30084 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ECHS1P30084 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ECHS1P30084 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ECHS1P30084 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ECHS1P30084 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ECHS1P30084 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ECHS1P30084 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ECHS1P30084 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ECHS1P30084 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ECHS1P30084 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ECHS1P30084 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ECHS1P30084 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ECHS1P30084 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ECHS1P30084 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ECHS1P30084 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ECHS1P30084 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ECHS1P30084 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ECHS1P30084 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ECHS1P30084 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ECHS1P30084 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ECHS1P30084 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ECHS1P30084 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ECHS1P30084 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ECHS1P30084 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECHS1P30084 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECHS1P30084 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECHS1P30084 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ECHS1P30084 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECHS1P30084 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ECHS1P30084 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ECHS1P30084 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ECHS1P30084 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECHS1P30084 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ECHS1P30084 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECHS1P30084 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECHS1P30084 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECHS1P30084 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECHS1P30084 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECHS1P30084 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECHS1P30084 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ECHS1P30084 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ECHS1P30084 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ECHS1P30084 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ECHS1P30084 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECHS1P30084 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECHS1P30084 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECHS1P30084 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECHS1P30084 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECHS1P30084 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ECHS1P30084 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ECHS1P30084 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ECHS1P30084 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ECHS1P30084 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ECHS1P30084 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ECHS1P30084 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ECHS1P30084 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ECHS1P30084 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ECHS1P30084 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECHS1P30084 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ECHS1P30084 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECHS1P30084 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECHS1P30084 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECHS1P30084 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECHS1P30084 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECHS1P30084 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECHS1P30084 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECHS1P30084 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECHS1P30084 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECHS1P30084 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECHS1P30084 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECHS1P30084 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECHS1P30084 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECHS1P30084 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECHS1P30084 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECHS1P30084 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECHS1P30084 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECHS1P30084 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms