Protein–RNA interactions for Protein: P29218

IMPA1, Inositol monophosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPA1P29218 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IMPA1P29218 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IMPA1P29218 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IMPA1P29218 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IMPA1P29218 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IMPA1P29218 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IMPA1P29218 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IMPA1P29218 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IMPA1P29218 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IMPA1P29218 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IMPA1P29218 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IMPA1P29218 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IMPA1P29218 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IMPA1P29218 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IMPA1P29218 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
IMPA1P29218 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IMPA1P29218 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IMPA1P29218 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IMPA1P29218 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IMPA1P29218 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IMPA1P29218 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IMPA1P29218 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IMPA1P29218 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IMPA1P29218 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IMPA1P29218 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IMPA1P29218 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IMPA1P29218 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IMPA1P29218 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IMPA1P29218 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IMPA1P29218 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IMPA1P29218 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IMPA1P29218 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IMPA1P29218 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IMPA1P29218 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IMPA1P29218 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IMPA1P29218 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
IMPA1P29218 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IMPA1P29218 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IMPA1P29218 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IMPA1P29218 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IMPA1P29218 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IMPA1P29218 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IMPA1P29218 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IMPA1P29218 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IMPA1P29218 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IMPA1P29218 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IMPA1P29218 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IMPA1P29218 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IMPA1P29218 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IMPA1P29218 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IMPA1P29218 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IMPA1P29218 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IMPA1P29218 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IMPA1P29218 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IMPA1P29218 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IMPA1P29218 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IMPA1P29218 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IMPA1P29218 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
IMPA1P29218 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IMPA1P29218 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IMPA1P29218 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
IMPA1P29218 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
IMPA1P29218 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IMPA1P29218 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IMPA1P29218 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IMPA1P29218 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IMPA1P29218 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IMPA1P29218 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IMPA1P29218 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IMPA1P29218 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IMPA1P29218 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IMPA1P29218 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IMPA1P29218 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IMPA1P29218 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IMPA1P29218 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IMPA1P29218 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IMPA1P29218 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IMPA1P29218 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IMPA1P29218 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IMPA1P29218 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IMPA1P29218 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IMPA1P29218 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
IMPA1P29218 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IMPA1P29218 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IMPA1P29218 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IMPA1P29218 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IMPA1P29218 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IMPA1P29218 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IMPA1P29218 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IMPA1P29218 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IMPA1P29218 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IMPA1P29218 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IMPA1P29218 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IMPA1P29218 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IMPA1P29218 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IMPA1P29218 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IMPA1P29218 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IMPA1P29218 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IMPA1P29218 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IMPA1P29218 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms