Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERCC5P28715 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERCC5P28715 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERCC5P28715 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERCC5P28715 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERCC5P28715 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERCC5P28715 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERCC5P28715 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERCC5P28715 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERCC5P28715 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERCC5P28715 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERCC5P28715 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERCC5P28715 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERCC5P28715 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERCC5P28715 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERCC5P28715 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERCC5P28715 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERCC5P28715 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERCC5P28715 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERCC5P28715 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
ERCC5P28715 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC5P28715 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC5P28715 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC5P28715 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC5P28715 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC5P28715 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC5P28715 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERCC5P28715 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERCC5P28715 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERCC5P28715 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERCC5P28715 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERCC5P28715 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERCC5P28715 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC5P28715 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC5P28715 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC5P28715 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC5P28715 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC5P28715 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC5P28715 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC5P28715 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC5P28715 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERCC5P28715 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERCC5P28715 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERCC5P28715 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERCC5P28715 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERCC5P28715 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERCC5P28715 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERCC5P28715 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERCC5P28715 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERCC5P28715 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERCC5P28715 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERCC5P28715 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERCC5P28715 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERCC5P28715 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERCC5P28715 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERCC5P28715 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERCC5P28715 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERCC5P28715 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERCC5P28715 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERCC5P28715 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERCC5P28715 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERCC5P28715 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERCC5P28715 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERCC5P28715 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERCC5P28715 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERCC5P28715 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERCC5P28715 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERCC5P28715 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERCC5P28715 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERCC5P28715 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERCC5P28715 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERCC5P28715 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERCC5P28715 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERCC5P28715 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERCC5P28715 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERCC5P28715 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERCC5P28715 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERCC5P28715 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERCC5P28715 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERCC5P28715 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERCC5P28715 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERCC5P28715 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERCC5P28715 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERCC5P28715 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERCC5P28715 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERCC5P28715 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC5P28715 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERCC5P28715 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERCC5P28715 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERCC5P28715 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERCC5P28715 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERCC5P28715 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC5P28715 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC5P28715 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC5P28715 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC5P28715 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC5P28715 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC5P28715 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC5P28715 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC5P28715 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms