Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMB4P28070 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMB4P28070 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMB4P28070 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMB4P28070 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMB4P28070 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMB4P28070 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMB4P28070 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMB4P28070 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMB4P28070 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMB4P28070 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMB4P28070 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMB4P28070 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMB4P28070 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMB4P28070 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMB4P28070 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMB4P28070 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMB4P28070 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMB4P28070 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMB4P28070 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMB4P28070 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMB4P28070 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMB4P28070 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMB4P28070 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMB4P28070 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMB4P28070 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMB4P28070 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMB4P28070 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMB4P28070 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMB4P28070 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMB4P28070 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMB4P28070 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMB4P28070 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMB4P28070 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMB4P28070 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMB4P28070 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMB4P28070 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMB4P28070 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMB4P28070 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMB4P28070 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMB4P28070 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMB4P28070 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMB4P28070 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMB4P28070 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMB4P28070 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSMB4P28070 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSMB4P28070 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSMB4P28070 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSMB4P28070 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMB4P28070 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMB4P28070 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMB4P28070 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMB4P28070 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMB4P28070 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMB4P28070 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMB4P28070 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMB4P28070 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMB4P28070 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMB4P28070 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMB4P28070 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMB4P28070 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMB4P28070 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMB4P28070 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMB4P28070 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMB4P28070 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMB4P28070 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMB4P28070 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMB4P28070 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMB4P28070 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMB4P28070 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMB4P28070 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMB4P28070 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMB4P28070 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMB4P28070 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMB4P28070 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PSMB4P28070 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMB4P28070 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMB4P28070 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMB4P28070 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMB4P28070 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMB4P28070 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMB4P28070 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMB4P28070 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMB4P28070 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMB4P28070 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMB4P28070 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMB4P28070 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMB4P28070 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMB4P28070 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMB4P28070 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMB4P28070 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMB4P28070 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMB4P28070 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMB4P28070 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMB4P28070 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMB4P28070 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMB4P28070 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMB4P28070 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMB4P28070 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMB4P28070 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms