Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CHMLP26374 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CHMLP26374 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CHMLP26374 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CHMLP26374 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CHMLP26374 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CHMLP26374 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CHMLP26374 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHMLP26374 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHMLP26374 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHMLP26374 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHMLP26374 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHMLP26374 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHMLP26374 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHMLP26374 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHMLP26374 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHMLP26374 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHMLP26374 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHMLP26374 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHMLP26374 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHMLP26374 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CHMLP26374 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHMLP26374 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHMLP26374 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CHMLP26374 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHMLP26374 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHMLP26374 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHMLP26374 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHMLP26374 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHMLP26374 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHMLP26374 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CHMLP26374 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CHMLP26374 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CHMLP26374 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHMLP26374 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHMLP26374 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHMLP26374 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CHMLP26374 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHMLP26374 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHMLP26374 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHMLP26374 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CHMLP26374 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHMLP26374 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHMLP26374 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHMLP26374 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CHMLP26374 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHMLP26374 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHMLP26374 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHMLP26374 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHMLP26374 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHMLP26374 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHMLP26374 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CHMLP26374 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CHMLP26374 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHMLP26374 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHMLP26374 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHMLP26374 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHMLP26374 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHMLP26374 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHMLP26374 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHMLP26374 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHMLP26374 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHMLP26374 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHMLP26374 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHMLP26374 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHMLP26374 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHMLP26374 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHMLP26374 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHMLP26374 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHMLP26374 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHMLP26374 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHMLP26374 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHMLP26374 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHMLP26374 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHMLP26374 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHMLP26374 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHMLP26374 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHMLP26374 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHMLP26374 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHMLP26374 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHMLP26374 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHMLP26374 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHMLP26374 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHMLP26374 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHMLP26374 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHMLP26374 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHMLP26374 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CHMLP26374 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHMLP26374 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHMLP26374 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHMLP26374 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHMLP26374 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHMLP26374 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHMLP26374 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHMLP26374 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHMLP26374 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHMLP26374 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHMLP26374 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHMLP26374 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHMLP26374 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms