Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTX3P26022 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTX3P26022 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTX3P26022 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTX3P26022 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTX3P26022 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTX3P26022 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTX3P26022 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTX3P26022 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTX3P26022 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTX3P26022 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTX3P26022 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTX3P26022 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTX3P26022 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTX3P26022 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTX3P26022 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTX3P26022 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTX3P26022 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTX3P26022 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTX3P26022 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTX3P26022 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTX3P26022 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTX3P26022 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTX3P26022 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTX3P26022 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTX3P26022 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTX3P26022 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTX3P26022 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTX3P26022 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTX3P26022 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTX3P26022 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTX3P26022 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTX3P26022 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTX3P26022 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTX3P26022 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTX3P26022 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTX3P26022 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTX3P26022 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTX3P26022 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTX3P26022 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTX3P26022 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTX3P26022 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTX3P26022 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTX3P26022 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTX3P26022 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTX3P26022 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTX3P26022 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTX3P26022 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTX3P26022 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTX3P26022 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTX3P26022 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTX3P26022 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTX3P26022 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTX3P26022 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTX3P26022 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTX3P26022 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTX3P26022 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTX3P26022 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTX3P26022 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTX3P26022 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTX3P26022 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTX3P26022 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTX3P26022 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTX3P26022 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTX3P26022 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTX3P26022 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTX3P26022 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTX3P26022 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTX3P26022 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTX3P26022 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTX3P26022 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTX3P26022 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTX3P26022 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTX3P26022 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTX3P26022 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTX3P26022 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTX3P26022 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTX3P26022 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTX3P26022 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTX3P26022 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTX3P26022 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTX3P26022 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTX3P26022 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTX3P26022 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTX3P26022 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTX3P26022 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTX3P26022 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTX3P26022 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTX3P26022 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTX3P26022 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTX3P26022 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTX3P26022 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTX3P26022 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTX3P26022 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTX3P26022 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTX3P26022 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTX3P26022 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTX3P26022 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTX3P26022 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTX3P26022 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms