Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSSP25774 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSSP25774 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSSP25774 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSSP25774 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSSP25774 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSSP25774 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSSP25774 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSSP25774 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSSP25774 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSSP25774 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSSP25774 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSSP25774 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSSP25774 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSSP25774 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSSP25774 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSSP25774 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSSP25774 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSSP25774 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSSP25774 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSSP25774 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSSP25774 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSSP25774 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSSP25774 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSSP25774 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSSP25774 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSSP25774 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSSP25774 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSSP25774 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSSP25774 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSSP25774 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSSP25774 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSSP25774 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSSP25774 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSSP25774 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSSP25774 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSSP25774 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSSP25774 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSSP25774 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSSP25774 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSSP25774 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTSSP25774 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTSSP25774 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSSP25774 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSSP25774 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSSP25774 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSSP25774 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSSP25774 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSSP25774 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSSP25774 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSSP25774 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSSP25774 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSSP25774 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSSP25774 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSSP25774 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSSP25774 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSSP25774 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSSP25774 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSSP25774 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSSP25774 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSSP25774 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSSP25774 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSSP25774 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSSP25774 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSSP25774 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSSP25774 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSSP25774 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSSP25774 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSSP25774 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSSP25774 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSSP25774 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSSP25774 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSSP25774 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSSP25774 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSSP25774 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSSP25774 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSSP25774 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSSP25774 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSSP25774 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTSSP25774 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSSP25774 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSSP25774 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSSP25774 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSSP25774 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSSP25774 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSSP25774 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSSP25774 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSSP25774 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSSP25774 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSSP25774 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSSP25774 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSSP25774 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSSP25774 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSSP25774 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSSP25774 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSSP25774 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSSP25774 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSSP25774 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSSP25774 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSSP25774 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms