Protein–RNA interactions for Protein: P25024

CXCR1, C-X-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR1P25024 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCR1P25024 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCR1P25024 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCR1P25024 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCR1P25024 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR1P25024 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR1P25024 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR1P25024 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR1P25024 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR1P25024 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR1P25024 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR1P25024 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR1P25024 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR1P25024 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCR1P25024 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCR1P25024 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCR1P25024 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR1P25024 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR1P25024 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR1P25024 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR1P25024 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR1P25024 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR1P25024 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR1P25024 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR1P25024 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR1P25024 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR1P25024 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR1P25024 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR1P25024 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CXCR1P25024 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CXCR1P25024 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
CXCR1P25024 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR1P25024 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR1P25024 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR1P25024 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR1P25024 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR1P25024 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR1P25024 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR1P25024 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR1P25024 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR1P25024 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR1P25024 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR1P25024 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR1P25024 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR1P25024 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR1P25024 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR1P25024 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR1P25024 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR1P25024 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR1P25024 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR1P25024 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR1P25024 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR1P25024 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR1P25024 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR1P25024 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR1P25024 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR1P25024 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR1P25024 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR1P25024 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR1P25024 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CXCR1P25024 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CXCR1P25024 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR1P25024 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR1P25024 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR1P25024 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR1P25024 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR1P25024 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR1P25024 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR1P25024 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR1P25024 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR1P25024 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR1P25024 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR1P25024 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR1P25024 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR1P25024 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR1P25024 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR1P25024 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR1P25024 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR1P25024 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR1P25024 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR1P25024 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR1P25024 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR1P25024 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR1P25024 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR1P25024 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR1P25024 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR1P25024 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR1P25024 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCR1P25024 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR1P25024 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR1P25024 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR1P25024 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR1P25024 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR1P25024 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR1P25024 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCR1P25024 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCR1P25024 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCR1P25024 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CXCR1P25024 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR1P25024 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms