Protein–RNA interactions for Protein: P23528

CFL1, Cofilin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFL1P23528 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFL1P23528 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFL1P23528 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFL1P23528 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFL1P23528 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFL1P23528 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFL1P23528 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFL1P23528 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFL1P23528 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFL1P23528 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFL1P23528 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFL1P23528 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFL1P23528 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFL1P23528 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFL1P23528 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFL1P23528 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFL1P23528 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFL1P23528 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFL1P23528 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFL1P23528 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFL1P23528 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFL1P23528 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CFL1P23528 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFL1P23528 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFL1P23528 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CFL1P23528 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFL1P23528 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFL1P23528 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CFL1P23528 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFL1P23528 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFL1P23528 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFL1P23528 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFL1P23528 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFL1P23528 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFL1P23528 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFL1P23528 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFL1P23528 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFL1P23528 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFL1P23528 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFL1P23528 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFL1P23528 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFL1P23528 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFL1P23528 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFL1P23528 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFL1P23528 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFL1P23528 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFL1P23528 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFL1P23528 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFL1P23528 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFL1P23528 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CFL1P23528 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFL1P23528 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFL1P23528 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFL1P23528 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFL1P23528 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFL1P23528 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFL1P23528 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFL1P23528 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFL1P23528 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFL1P23528 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFL1P23528 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFL1P23528 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFL1P23528 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFL1P23528 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFL1P23528 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFL1P23528 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFL1P23528 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFL1P23528 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFL1P23528 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFL1P23528 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFL1P23528 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CFL1P23528 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFL1P23528 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFL1P23528 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFL1P23528 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFL1P23528 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFL1P23528 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFL1P23528 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CFL1P23528 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFL1P23528 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFL1P23528 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFL1P23528 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFL1P23528 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFL1P23528 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFL1P23528 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFL1P23528 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFL1P23528 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFL1P23528 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFL1P23528 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFL1P23528 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFL1P23528 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFL1P23528 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFL1P23528 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFL1P23528 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFL1P23528 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFL1P23528 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFL1P23528 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFL1P23528 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFL1P23528 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFL1P23528 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms