Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
PTPRGP23470 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC39.99■■■■□ 3.99
PTPRGP23470 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
PTPRGP23470 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
PTPRGP23470 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC39.98■■■■□ 3.99
PTPRGP23470 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
PTPRGP23470 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
PTPRGP23470 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
PTPRGP23470 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
PTPRGP23470 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
PTPRGP23470 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
PTPRGP23470 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
PTPRGP23470 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
PTPRGP23470 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
PTPRGP23470 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
PTPRGP23470 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
PTPRGP23470 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
PTPRGP23470 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
PTPRGP23470 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
PTPRGP23470 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
PTPRGP23470 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
PTPRGP23470 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
PTPRGP23470 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
PTPRGP23470 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
PTPRGP23470 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
PTPRGP23470 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
PTPRGP23470 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
PTPRGP23470 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
PTPRGP23470 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
PTPRGP23470 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
PTPRGP23470 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
PTPRGP23470 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
PTPRGP23470 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
PTPRGP23470 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
PTPRGP23470 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
PTPRGP23470 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
PTPRGP23470 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
PTPRGP23470 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
PTPRGP23470 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
PTPRGP23470 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
PTPRGP23470 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
PTPRGP23470 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
PTPRGP23470 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
PTPRGP23470 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
PTPRGP23470 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.86■■■■□ 3.97
PTPRGP23470 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
PTPRGP23470 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
PTPRGP23470 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
PTPRGP23470 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
PTPRGP23470 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
PTPRGP23470 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
PTPRGP23470 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
PTPRGP23470 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
PTPRGP23470 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC39.83■■■■□ 3.97
PTPRGP23470 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC39.82■■■■□ 3.97
PTPRGP23470 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC39.82■■■■□ 3.96
PTPRGP23470 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC39.81■■■■□ 3.96
PTPRGP23470 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
PTPRGP23470 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
PTPRGP23470 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
PTPRGP23470 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
PTPRGP23470 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
PTPRGP23470 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
PTPRGP23470 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
PTPRGP23470 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
PTPRGP23470 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC39.74■■■■□ 3.95
PTPRGP23470 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
PTPRGP23470 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
PTPRGP23470 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
PTPRGP23470 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
PTPRGP23470 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
PTPRGP23470 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC39.71■■■■□ 3.95
PTPRGP23470 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
PTPRGP23470 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PTPRGP23470 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PTPRGP23470 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PTPRGP23470 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
PTPRGP23470 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
PTPRGP23470 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
PTPRGP23470 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC39.69■■■■□ 3.94
PTPRGP23470 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
PTPRGP23470 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC39.69■■■■□ 3.94
PTPRGP23470 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
PTPRGP23470 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
PTPRGP23470 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
PTPRGP23470 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
PTPRGP23470 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
PTPRGP23470 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
PTPRGP23470 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
PTPRGP23470 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
PTPRGP23470 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
PTPRGP23470 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
PTPRGP23470 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
PTPRGP23470 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
PTPRGP23470 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
PTPRGP23470 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
PTPRGP23470 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
PTPRGP23470 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
PTPRGP23470 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
PTPRGP23470 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms