Protein–RNA interactions for Protein: P23258

TUBG1, Tubulin gamma-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG1P23258 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBG1P23258 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBG1P23258 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBG1P23258 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBG1P23258 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBG1P23258 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBG1P23258 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBG1P23258 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBG1P23258 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBG1P23258 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBG1P23258 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBG1P23258 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBG1P23258 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBG1P23258 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBG1P23258 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBG1P23258 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBG1P23258 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBG1P23258 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBG1P23258 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBG1P23258 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBG1P23258 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBG1P23258 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBG1P23258 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBG1P23258 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBG1P23258 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBG1P23258 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBG1P23258 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBG1P23258 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TUBG1P23258 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBG1P23258 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBG1P23258 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBG1P23258 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBG1P23258 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBG1P23258 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TUBG1P23258 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBG1P23258 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBG1P23258 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBG1P23258 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBG1P23258 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBG1P23258 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBG1P23258 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBG1P23258 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBG1P23258 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBG1P23258 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBG1P23258 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBG1P23258 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBG1P23258 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBG1P23258 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBG1P23258 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBG1P23258 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBG1P23258 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBG1P23258 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBG1P23258 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBG1P23258 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBG1P23258 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBG1P23258 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBG1P23258 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBG1P23258 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBG1P23258 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBG1P23258 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBG1P23258 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBG1P23258 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBG1P23258 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBG1P23258 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBG1P23258 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBG1P23258 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBG1P23258 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBG1P23258 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBG1P23258 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBG1P23258 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBG1P23258 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBG1P23258 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBG1P23258 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBG1P23258 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBG1P23258 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBG1P23258 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBG1P23258 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBG1P23258 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBG1P23258 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBG1P23258 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBG1P23258 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBG1P23258 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBG1P23258 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBG1P23258 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBG1P23258 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBG1P23258 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBG1P23258 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBG1P23258 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBG1P23258 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBG1P23258 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBG1P23258 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBG1P23258 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBG1P23258 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBG1P23258 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBG1P23258 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBG1P23258 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBG1P23258 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBG1P23258 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBG1P23258 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBG1P23258 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms