Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CASTP20810 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CASTP20810 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CASTP20810 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CASTP20810 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CASTP20810 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CASTP20810 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CASTP20810 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CASTP20810 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CASTP20810 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CASTP20810 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CASTP20810 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CASTP20810 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CASTP20810 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CASTP20810 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CASTP20810 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CASTP20810 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CASTP20810 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CASTP20810 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CASTP20810 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CASTP20810 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CASTP20810 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CASTP20810 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CASTP20810 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CASTP20810 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CASTP20810 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CASTP20810 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CASTP20810 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CASTP20810 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CASTP20810 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CASTP20810 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CASTP20810 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CASTP20810 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CASTP20810 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CASTP20810 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CASTP20810 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CASTP20810 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CASTP20810 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CASTP20810 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CASTP20810 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CASTP20810 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CASTP20810 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CASTP20810 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CASTP20810 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CASTP20810 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CASTP20810 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CASTP20810 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CASTP20810 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CASTP20810 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CASTP20810 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CASTP20810 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CASTP20810 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CASTP20810 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CASTP20810 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CASTP20810 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CASTP20810 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CASTP20810 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CASTP20810 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CASTP20810 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CASTP20810 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CASTP20810 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CASTP20810 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CASTP20810 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CASTP20810 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CASTP20810 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CASTP20810 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CASTP20810 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CASTP20810 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CASTP20810 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CASTP20810 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CASTP20810 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CASTP20810 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CASTP20810 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CASTP20810 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CASTP20810 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CASTP20810 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CASTP20810 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CASTP20810 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CASTP20810 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CASTP20810 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CASTP20810 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CASTP20810 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CASTP20810 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CASTP20810 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CASTP20810 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CASTP20810 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CASTP20810 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CASTP20810 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CASTP20810 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CASTP20810 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CASTP20810 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CASTP20810 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CASTP20810 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CASTP20810 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CASTP20810 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CASTP20810 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CASTP20810 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CASTP20810 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CASTP20810 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CASTP20810 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms