Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
LMNB1P20700 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
LMNB1P20700 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
LMNB1P20700 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
LMNB1P20700 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
LMNB1P20700 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
LMNB1P20700 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
LMNB1P20700 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
LMNB1P20700 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC30.7■■■□□ 2.51
LMNB1P20700 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
LMNB1P20700 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
LMNB1P20700 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
LMNB1P20700 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
LMNB1P20700 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
LMNB1P20700 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
LMNB1P20700 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.67■■■□□ 2.5
LMNB1P20700 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
LMNB1P20700 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
LMNB1P20700 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
LMNB1P20700 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
LMNB1P20700 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
LMNB1P20700 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
LMNB1P20700 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
LMNB1P20700 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
LMNB1P20700 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
LMNB1P20700 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
LMNB1P20700 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
LMNB1P20700 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
LMNB1P20700 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
LMNB1P20700 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
LMNB1P20700 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
LMNB1P20700 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LMNB1P20700 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LMNB1P20700 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
LMNB1P20700 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
LMNB1P20700 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LMNB1P20700 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LMNB1P20700 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
LMNB1P20700 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
LMNB1P20700 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LMNB1P20700 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LMNB1P20700 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
LMNB1P20700 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
LMNB1P20700 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LMNB1P20700 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LMNB1P20700 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LMNB1P20700 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LMNB1P20700 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LMNB1P20700 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
LMNB1P20700 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LMNB1P20700 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
LMNB1P20700 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
LMNB1P20700 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
LMNB1P20700 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
LMNB1P20700 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
LMNB1P20700 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LMNB1P20700 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
LMNB1P20700 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
LMNB1P20700 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LMNB1P20700 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LMNB1P20700 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
LMNB1P20700 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
LMNB1P20700 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
LMNB1P20700 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
LMNB1P20700 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMNB1P20700 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMNB1P20700 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMNB1P20700 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMNB1P20700 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
LMNB1P20700 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMNB1P20700 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMNB1P20700 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
LMNB1P20700 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
LMNB1P20700 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
LMNB1P20700 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LMNB1P20700 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LMNB1P20700 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LMNB1P20700 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LMNB1P20700 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LMNB1P20700 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LMNB1P20700 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
LMNB1P20700 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LMNB1P20700 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
LMNB1P20700 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMNB1P20700 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMNB1P20700 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMNB1P20700 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMNB1P20700 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LMNB1P20700 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
LMNB1P20700 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LMNB1P20700 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LMNB1P20700 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
LMNB1P20700 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
LMNB1P20700 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
LMNB1P20700 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
LMNB1P20700 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LMNB1P20700 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
LMNB1P20700 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LMNB1P20700 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LMNB1P20700 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms