Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB4AP20338 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB4AP20338 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB4AP20338 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB4AP20338 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RAB4AP20338 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB4AP20338 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms