Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL3L1P16619 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL3L1P16619 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL3L1P16619 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL3L1P16619 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL3L1P16619 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL3L1P16619 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCL3L1P16619 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCL3L1P16619 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCL3L1P16619 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCL3L1P16619 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCL3L1P16619 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCL3L1P16619 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCL3L1P16619 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCL3L1P16619 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCL3L1P16619 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCL3L1P16619 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCL3L1P16619 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCL3L1P16619 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCL3L1P16619 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCL3L1P16619 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCL3L1P16619 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCL3L1P16619 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCL3L1P16619 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCL3L1P16619 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCL3L1P16619 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCL3L1P16619 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL3L1P16619 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL3L1P16619 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL3L1P16619 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL3L1P16619 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL3L1P16619 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL3L1P16619 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL3L1P16619 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL3L1P16619 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL3L1P16619 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL3L1P16619 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL3L1P16619 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL3L1P16619 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL3L1P16619 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL3L1P16619 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL3L1P16619 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCL3L1P16619 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCL3L1P16619 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCL3L1P16619 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCL3L1P16619 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL3L1P16619 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL3L1P16619 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL3L1P16619 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL3L1P16619 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL3L1P16619 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL3L1P16619 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL3L1P16619 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL3L1P16619 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL3L1P16619 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL3L1P16619 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL3L1P16619 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL3L1P16619 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL3L1P16619 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL3L1P16619 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms