Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CD44P16070 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD44P16070 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CD44P16070 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CD44P16070 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CD44P16070 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CD44P16070 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CD44P16070 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CD44P16070 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CD44P16070 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CD44P16070 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CD44P16070 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD44P16070 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD44P16070 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD44P16070 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD44P16070 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD44P16070 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD44P16070 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CD44P16070 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CD44P16070 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CD44P16070 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CD44P16070 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD44P16070 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD44P16070 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD44P16070 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD44P16070 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD44P16070 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD44P16070 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD44P16070 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD44P16070 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CD44P16070 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CD44P16070 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CD44P16070 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CD44P16070 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CD44P16070 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CD44P16070 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CD44P16070 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CD44P16070 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CD44P16070 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CD44P16070 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CD44P16070 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CD44P16070 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CD44P16070 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CD44P16070 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CD44P16070 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CD44P16070 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CD44P16070 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CD44P16070 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CD44P16070 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CD44P16070 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CD44P16070 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD44P16070 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD44P16070 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD44P16070 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD44P16070 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD44P16070 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD44P16070 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD44P16070 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD44P16070 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CD44P16070 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CD44P16070 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CD44P16070 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CD44P16070 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CD44P16070 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CD44P16070 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CD44P16070 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CD44P16070 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CD44P16070 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CD44P16070 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CD44P16070 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CD44P16070 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CD44P16070 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CD44P16070 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CD44P16070 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CD44P16070 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CD44P16070 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CD44P16070 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CD44P16070 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CD44P16070 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CD44P16070 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CD44P16070 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CD44P16070 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CD44P16070 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CD44P16070 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CD44P16070 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CD44P16070 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CD44P16070 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CD44P16070 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CD44P16070 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CD44P16070 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CD44P16070 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CD44P16070 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CD44P16070 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CD44P16070 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CD44P16070 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CD44P16070 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CD44P16070 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CD44P16070 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CD44P16070 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CD44P16070 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms