Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNT1P13805 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNT1P13805 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNT1P13805 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNT1P13805 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNT1P13805 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNT1P13805 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNT1P13805 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNT1P13805 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNT1P13805 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNT1P13805 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNT1P13805 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNT1P13805 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNT1P13805 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNT1P13805 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNT1P13805 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNT1P13805 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNT1P13805 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNT1P13805 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNT1P13805 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNT1P13805 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNT1P13805 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNT1P13805 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNT1P13805 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNT1P13805 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNT1P13805 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNT1P13805 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNT1P13805 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNT1P13805 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNT1P13805 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNT1P13805 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNT1P13805 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNT1P13805 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNT1P13805 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNT1P13805 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNT1P13805 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNT1P13805 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNT1P13805 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNT1P13805 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNT1P13805 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNT1P13805 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNT1P13805 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNT1P13805 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNT1P13805 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNT1P13805 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNT1P13805 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNT1P13805 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNT1P13805 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNT1P13805 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNT1P13805 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNT1P13805 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNT1P13805 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNT1P13805 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNT1P13805 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNT1P13805 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNT1P13805 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNT1P13805 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TNNT1P13805 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TNNT1P13805 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TNNT1P13805 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNT1P13805 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNT1P13805 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNT1P13805 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNT1P13805 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNT1P13805 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNT1P13805 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNT1P13805 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNT1P13805 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNT1P13805 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNT1P13805 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNT1P13805 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNT1P13805 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNT1P13805 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNT1P13805 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNT1P13805 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNT1P13805 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNT1P13805 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNT1P13805 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNT1P13805 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNT1P13805 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNT1P13805 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNT1P13805 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNT1P13805 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNT1P13805 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNT1P13805 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNT1P13805 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNT1P13805 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNT1P13805 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNT1P13805 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNT1P13805 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNT1P13805 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNT1P13805 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNT1P13805 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNT1P13805 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNT1P13805 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNT1P13805 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNT1P13805 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNT1P13805 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNT1P13805 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNT1P13805 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 333.2 ms