Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
VPREB1P12018 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPREB1P12018 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms