Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PYGBP11216 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PYGBP11216 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PYGBP11216 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PYGBP11216 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PYGBP11216 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PYGBP11216 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PYGBP11216 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PYGBP11216 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PYGBP11216 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PYGBP11216 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PYGBP11216 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PYGBP11216 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PYGBP11216 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PYGBP11216 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PYGBP11216 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PYGBP11216 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PYGBP11216 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PYGBP11216 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PYGBP11216 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PYGBP11216 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PYGBP11216 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PYGBP11216 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PYGBP11216 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PYGBP11216 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PYGBP11216 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PYGBP11216 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PYGBP11216 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PYGBP11216 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PYGBP11216 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PYGBP11216 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PYGBP11216 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PYGBP11216 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PYGBP11216 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PYGBP11216 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PYGBP11216 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PYGBP11216 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PYGBP11216 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PYGBP11216 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PYGBP11216 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PYGBP11216 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PYGBP11216 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PYGBP11216 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PYGBP11216 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PYGBP11216 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PYGBP11216 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PYGBP11216 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PYGBP11216 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PYGBP11216 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PYGBP11216 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PYGBP11216 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PYGBP11216 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PYGBP11216 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PYGBP11216 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PYGBP11216 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PYGBP11216 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PYGBP11216 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PYGBP11216 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PYGBP11216 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PYGBP11216 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PYGBP11216 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PYGBP11216 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PYGBP11216 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PYGBP11216 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PYGBP11216 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PYGBP11216 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PYGBP11216 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PYGBP11216 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PYGBP11216 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PYGBP11216 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PYGBP11216 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PYGBP11216 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PYGBP11216 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PYGBP11216 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PYGBP11216 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PYGBP11216 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PYGBP11216 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PYGBP11216 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PYGBP11216 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PYGBP11216 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PYGBP11216 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PYGBP11216 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PYGBP11216 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PYGBP11216 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PYGBP11216 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PYGBP11216 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PYGBP11216 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PYGBP11216 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PYGBP11216 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PYGBP11216 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PYGBP11216 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PYGBP11216 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PYGBP11216 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PYGBP11216 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PYGBP11216 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PYGBP11216 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PYGBP11216 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PYGBP11216 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PYGBP11216 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PYGBP11216 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms