Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
UBBP0CG47 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBBP0CG47 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBBP0CG47 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBBP0CG47 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBBP0CG47 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBBP0CG47 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBBP0CG47 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBBP0CG47 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBBP0CG47 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
UBBP0CG47 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBBP0CG47 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBBP0CG47 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBBP0CG47 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBBP0CG47 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBBP0CG47 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBBP0CG47 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBBP0CG47 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBBP0CG47 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBBP0CG47 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBBP0CG47 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBBP0CG47 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
UBBP0CG47 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
UBBP0CG47 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBBP0CG47 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
UBBP0CG47 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBBP0CG47 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBBP0CG47 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBBP0CG47 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBBP0CG47 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBBP0CG47 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBBP0CG47 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBBP0CG47 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBBP0CG47 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBBP0CG47 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBBP0CG47 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBBP0CG47 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBBP0CG47 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBBP0CG47 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBBP0CG47 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBBP0CG47 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBBP0CG47 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBBP0CG47 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBBP0CG47 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBBP0CG47 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBBP0CG47 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBBP0CG47 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBBP0CG47 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBBP0CG47 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
UBBP0CG47 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBBP0CG47 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
UBBP0CG47 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBBP0CG47 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBBP0CG47 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBBP0CG47 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBBP0CG47 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBBP0CG47 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBBP0CG47 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBBP0CG47 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBBP0CG47 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBBP0CG47 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBBP0CG47 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBBP0CG47 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBBP0CG47 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBBP0CG47 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBBP0CG47 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBBP0CG47 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBBP0CG47 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBBP0CG47 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBBP0CG47 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBBP0CG47 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBBP0CG47 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBBP0CG47 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBBP0CG47 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBBP0CG47 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBBP0CG47 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBBP0CG47 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBBP0CG47 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBBP0CG47 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBBP0CG47 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBBP0CG47 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBBP0CG47 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
UBBP0CG47 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBBP0CG47 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBBP0CG47 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBBP0CG47 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBBP0CG47 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBBP0CG47 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBBP0CG47 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBBP0CG47 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBBP0CG47 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBBP0CG47 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBBP0CG47 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBBP0CG47 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
UBBP0CG47 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBBP0CG47 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBBP0CG47 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBBP0CG47 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBBP0CG47 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBBP0CG47 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms