Protein–RNA interactions for Protein: P0CG37

CFC1, Cryptic protein, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFC1P0CG37 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFC1P0CG37 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFC1P0CG37 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFC1P0CG37 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFC1P0CG37 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFC1P0CG37 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFC1P0CG37 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFC1P0CG37 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFC1P0CG37 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFC1P0CG37 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFC1P0CG37 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFC1P0CG37 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFC1P0CG37 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFC1P0CG37 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFC1P0CG37 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFC1P0CG37 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFC1P0CG37 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFC1P0CG37 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFC1P0CG37 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFC1P0CG37 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFC1P0CG37 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFC1P0CG37 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFC1P0CG37 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFC1P0CG37 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFC1P0CG37 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFC1P0CG37 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFC1P0CG37 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFC1P0CG37 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CFC1P0CG37 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFC1P0CG37 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFC1P0CG37 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFC1P0CG37 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CFC1P0CG37 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CFC1P0CG37 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFC1P0CG37 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFC1P0CG37 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFC1P0CG37 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFC1P0CG37 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFC1P0CG37 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFC1P0CG37 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFC1P0CG37 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFC1P0CG37 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFC1P0CG37 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFC1P0CG37 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFC1P0CG37 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFC1P0CG37 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFC1P0CG37 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFC1P0CG37 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFC1P0CG37 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFC1P0CG37 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFC1P0CG37 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFC1P0CG37 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFC1P0CG37 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFC1P0CG37 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms