Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTXN2P0C2S0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTXN2P0C2S0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTXN2P0C2S0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTXN2P0C2S0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTXN2P0C2S0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTXN2P0C2S0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTXN2P0C2S0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTXN2P0C2S0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTXN2P0C2S0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTXN2P0C2S0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTXN2P0C2S0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTXN2P0C2S0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTXN2P0C2S0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTXN2P0C2S0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTXN2P0C2S0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTXN2P0C2S0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTXN2P0C2S0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTXN2P0C2S0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTXN2P0C2S0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTXN2P0C2S0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTXN2P0C2S0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN2P0C2S0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN2P0C2S0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN2P0C2S0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN2P0C2S0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN2P0C2S0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN2P0C2S0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN2P0C2S0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN2P0C2S0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN2P0C2S0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN2P0C2S0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN2P0C2S0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN2P0C2S0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN2P0C2S0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN2P0C2S0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN2P0C2S0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN2P0C2S0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN2P0C2S0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN2P0C2S0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTXN2P0C2S0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTXN2P0C2S0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms