Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PARP1P09874 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PARP1P09874 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PARP1P09874 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PARP1P09874 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PARP1P09874 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PARP1P09874 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PARP1P09874 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PARP1P09874 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PARP1P09874 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PARP1P09874 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PARP1P09874 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PARP1P09874 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PARP1P09874 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PARP1P09874 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PARP1P09874 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PARP1P09874 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PARP1P09874 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PARP1P09874 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PARP1P09874 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PARP1P09874 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PARP1P09874 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PARP1P09874 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PARP1P09874 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PARP1P09874 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PARP1P09874 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PARP1P09874 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PARP1P09874 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PARP1P09874 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PARP1P09874 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PARP1P09874 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PARP1P09874 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PARP1P09874 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PARP1P09874 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PARP1P09874 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PARP1P09874 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PARP1P09874 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PARP1P09874 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PARP1P09874 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PARP1P09874 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PARP1P09874 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PARP1P09874 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PARP1P09874 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PARP1P09874 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PARP1P09874 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PARP1P09874 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PARP1P09874 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PARP1P09874 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PARP1P09874 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PARP1P09874 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PARP1P09874 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PARP1P09874 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PARP1P09874 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PARP1P09874 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PARP1P09874 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PARP1P09874 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PARP1P09874 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PARP1P09874 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PARP1P09874 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PARP1P09874 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PARP1P09874 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PARP1P09874 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PARP1P09874 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PARP1P09874 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PARP1P09874 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PARP1P09874 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PARP1P09874 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PARP1P09874 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PARP1P09874 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PARP1P09874 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PARP1P09874 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PARP1P09874 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PARP1P09874 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PARP1P09874 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PARP1P09874 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PARP1P09874 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PARP1P09874 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PARP1P09874 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PARP1P09874 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PARP1P09874 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PARP1P09874 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PARP1P09874 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PARP1P09874 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PARP1P09874 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PARP1P09874 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PARP1P09874 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PARP1P09874 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PARP1P09874 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PARP1P09874 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PARP1P09874 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PARP1P09874 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PARP1P09874 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PARP1P09874 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PARP1P09874 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PARP1P09874 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PARP1P09874 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PARP1P09874 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PARP1P09874 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PARP1P09874 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PARP1P09874 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms