Protein–RNA interactions for Protein: P08962

CD63, CD63 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD63P08962 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD63P08962 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD63P08962 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD63P08962 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD63P08962 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CD63P08962 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CD63P08962 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD63P08962 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD63P08962 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD63P08962 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD63P08962 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CD63P08962 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD63P08962 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD63P08962 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD63P08962 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD63P08962 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD63P08962 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD63P08962 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD63P08962 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD63P08962 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD63P08962 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD63P08962 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD63P08962 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CD63P08962 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CD63P08962 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD63P08962 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD63P08962 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD63P08962 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CD63P08962 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD63P08962 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD63P08962 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD63P08962 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD63P08962 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD63P08962 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CD63P08962 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD63P08962 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD63P08962 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD63P08962 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD63P08962 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD63P08962 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD63P08962 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD63P08962 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD63P08962 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD63P08962 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD63P08962 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD63P08962 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD63P08962 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD63P08962 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD63P08962 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD63P08962 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD63P08962 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD63P08962 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD63P08962 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD63P08962 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD63P08962 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD63P08962 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD63P08962 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD63P08962 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD63P08962 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD63P08962 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CD63P08962 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD63P08962 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD63P08962 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD63P08962 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD63P08962 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD63P08962 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD63P08962 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD63P08962 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD63P08962 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD63P08962 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD63P08962 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD63P08962 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD63P08962 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD63P08962 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD63P08962 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD63P08962 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CD63P08962 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD63P08962 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD63P08962 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD63P08962 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD63P08962 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD63P08962 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD63P08962 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD63P08962 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD63P08962 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD63P08962 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD63P08962 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD63P08962 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD63P08962 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CD63P08962 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD63P08962 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD63P08962 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD63P08962 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD63P08962 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD63P08962 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD63P08962 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD63P08962 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD63P08962 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD63P08962 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD63P08962 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms