Protein–RNA interactions for Protein: P07437

TUBB, Tubulin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP07437 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBBP07437 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBBP07437 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBBP07437 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBBP07437 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBBP07437 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBBP07437 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBBP07437 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBBP07437 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBBP07437 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBBP07437 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBBP07437 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBBP07437 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBBP07437 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBBP07437 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBBP07437 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBBP07437 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBBP07437 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBBP07437 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBBP07437 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBBP07437 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBBP07437 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBBP07437 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBBP07437 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBBP07437 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBBP07437 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBBP07437 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBBP07437 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBBP07437 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBBP07437 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBBP07437 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBBP07437 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBBP07437 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBBP07437 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBBP07437 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TUBBP07437 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
TUBBP07437 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TUBBP07437 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBBP07437 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBBP07437 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBBP07437 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBBP07437 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBBP07437 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBBP07437 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBBP07437 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBBP07437 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBBP07437 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBBP07437 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBBP07437 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBBP07437 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBBP07437 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBBP07437 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBBP07437 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBBP07437 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBBP07437 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBBP07437 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBBP07437 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBBP07437 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBBP07437 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBBP07437 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBBP07437 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBBP07437 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBBP07437 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBBP07437 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBBP07437 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBBP07437 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TUBBP07437 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBBP07437 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBBP07437 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBBP07437 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBBP07437 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBBP07437 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBBP07437 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBBP07437 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBBP07437 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBBP07437 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBBP07437 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBBP07437 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBBP07437 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBBP07437 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBBP07437 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBBP07437 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBBP07437 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBBP07437 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBBP07437 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBBP07437 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBBP07437 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBBP07437 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBBP07437 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBBP07437 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBBP07437 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBBP07437 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TUBBP07437 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBBP07437 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBBP07437 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBBP07437 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBBP07437 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBBP07437 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBBP07437 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBBP07437 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms