Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLBP06746 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLBP06746 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLBP06746 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLBP06746 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLBP06746 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLBP06746 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLBP06746 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
POLBP06746 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLBP06746 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLBP06746 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLBP06746 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLBP06746 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLBP06746 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLBP06746 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLBP06746 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
POLBP06746 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLBP06746 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLBP06746 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLBP06746 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
POLBP06746 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLBP06746 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
POLBP06746 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLBP06746 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLBP06746 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLBP06746 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLBP06746 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLBP06746 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLBP06746 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLBP06746 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLBP06746 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLBP06746 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLBP06746 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLBP06746 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLBP06746 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLBP06746 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLBP06746 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLBP06746 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLBP06746 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLBP06746 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLBP06746 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
POLBP06746 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLBP06746 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLBP06746 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
POLBP06746 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLBP06746 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLBP06746 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLBP06746 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLBP06746 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLBP06746 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLBP06746 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLBP06746 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLBP06746 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLBP06746 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLBP06746 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLBP06746 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLBP06746 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLBP06746 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLBP06746 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLBP06746 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLBP06746 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLBP06746 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLBP06746 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLBP06746 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLBP06746 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
POLBP06746 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLBP06746 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLBP06746 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLBP06746 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLBP06746 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLBP06746 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLBP06746 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLBP06746 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLBP06746 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLBP06746 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLBP06746 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
POLBP06746 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLBP06746 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLBP06746 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLBP06746 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLBP06746 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLBP06746 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLBP06746 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLBP06746 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLBP06746 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
POLBP06746 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLBP06746 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLBP06746 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLBP06746 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLBP06746 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
POLBP06746 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLBP06746 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLBP06746 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLBP06746 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLBP06746 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLBP06746 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLBP06746 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLBP06746 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLBP06746 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLBP06746 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms