Protein–RNA interactions for Protein: P05000

IFNW1, Interferon omega-1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNW1P05000 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNW1P05000 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
IFNW1P05000 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
IFNW1P05000 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNW1P05000 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNW1P05000 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNW1P05000 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNW1P05000 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNW1P05000 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNW1P05000 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNW1P05000 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNW1P05000 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNW1P05000 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNW1P05000 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNW1P05000 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNW1P05000 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNW1P05000 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNW1P05000 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNW1P05000 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNW1P05000 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNW1P05000 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNW1P05000 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNW1P05000 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNW1P05000 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNW1P05000 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNW1P05000 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNW1P05000 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNW1P05000 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNW1P05000 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNW1P05000 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNW1P05000 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNW1P05000 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNW1P05000 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNW1P05000 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNW1P05000 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNW1P05000 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNW1P05000 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNW1P05000 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNW1P05000 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNW1P05000 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNW1P05000 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNW1P05000 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNW1P05000 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNW1P05000 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNW1P05000 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNW1P05000 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNW1P05000 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNW1P05000 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNW1P05000 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNW1P05000 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNW1P05000 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNW1P05000 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNW1P05000 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNW1P05000 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNW1P05000 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNW1P05000 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNW1P05000 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNW1P05000 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNW1P05000 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNW1P05000 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNW1P05000 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNW1P05000 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms