Protein–RNA interactions for Protein: P03891

MT-ND2, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND2P03891 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MT-ND2P03891 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MT-ND2P03891 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MT-ND2P03891 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MT-ND2P03891 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MT-ND2P03891 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MT-ND2P03891 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MT-ND2P03891 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MT-ND2P03891 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MT-ND2P03891 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MT-ND2P03891 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MT-ND2P03891 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MT-ND2P03891 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MT-ND2P03891 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MT-ND2P03891 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MT-ND2P03891 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MT-ND2P03891 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MT-ND2P03891 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MT-ND2P03891 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MT-ND2P03891 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MT-ND2P03891 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MT-ND2P03891 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MT-ND2P03891 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MT-ND2P03891 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MT-ND2P03891 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MT-ND2P03891 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MT-ND2P03891 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MT-ND2P03891 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MT-ND2P03891 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MT-ND2P03891 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MT-ND2P03891 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MT-ND2P03891 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MT-ND2P03891 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MT-ND2P03891 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MT-ND2P03891 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MT-ND2P03891 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MT-ND2P03891 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MT-ND2P03891 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MT-ND2P03891 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MT-ND2P03891 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MT-ND2P03891 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MT-ND2P03891 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MT-ND2P03891 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MT-ND2P03891 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MT-ND2P03891 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MT-ND2P03891 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MT-ND2P03891 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MT-ND2P03891 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MT-ND2P03891 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MT-ND2P03891 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MT-ND2P03891 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MT-ND2P03891 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MT-ND2P03891 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MT-ND2P03891 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MT-ND2P03891 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MT-ND2P03891 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MT-ND2P03891 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MT-ND2P03891 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MT-ND2P03891 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MT-ND2P03891 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MT-ND2P03891 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MT-ND2P03891 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MT-ND2P03891 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MT-ND2P03891 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MT-ND2P03891 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MT-ND2P03891 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MT-ND2P03891 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MT-ND2P03891 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MT-ND2P03891 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MT-ND2P03891 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MT-ND2P03891 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MT-ND2P03891 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MT-ND2P03891 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MT-ND2P03891 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MT-ND2P03891 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MT-ND2P03891 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MT-ND2P03891 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MT-ND2P03891 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MT-ND2P03891 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MT-ND2P03891 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MT-ND2P03891 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MT-ND2P03891 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MT-ND2P03891 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MT-ND2P03891 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MT-ND2P03891 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MT-ND2P03891 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MT-ND2P03891 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MT-ND2P03891 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MT-ND2P03891 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MT-ND2P03891 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MT-ND2P03891 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MT-ND2P03891 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MT-ND2P03891 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms