Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FGAP02671 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FGAP02671 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FGAP02671 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FGAP02671 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FGAP02671 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FGAP02671 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FGAP02671 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FGAP02671 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FGAP02671 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FGAP02671 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FGAP02671 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FGAP02671 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FGAP02671 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FGAP02671 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
FGAP02671 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
FGAP02671 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FGAP02671 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FGAP02671 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FGAP02671 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FGAP02671 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FGAP02671 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FGAP02671 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FGAP02671 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FGAP02671 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FGAP02671 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FGAP02671 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FGAP02671 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FGAP02671 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FGAP02671 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FGAP02671 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FGAP02671 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FGAP02671 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FGAP02671 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FGAP02671 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FGAP02671 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
FGAP02671 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FGAP02671 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FGAP02671 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
FGAP02671 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FGAP02671 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FGAP02671 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
FGAP02671 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FGAP02671 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FGAP02671 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FGAP02671 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FGAP02671 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FGAP02671 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FGAP02671 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FGAP02671 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FGAP02671 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FGAP02671 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FGAP02671 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FGAP02671 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FGAP02671 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FGAP02671 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FGAP02671 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FGAP02671 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
FGAP02671 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FGAP02671 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FGAP02671 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FGAP02671 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FGAP02671 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FGAP02671 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FGAP02671 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FGAP02671 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FGAP02671 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FGAP02671 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FGAP02671 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FGAP02671 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FGAP02671 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FGAP02671 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FGAP02671 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FGAP02671 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FGAP02671 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
FGAP02671 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FGAP02671 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FGAP02671 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FGAP02671 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FGAP02671 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FGAP02671 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FGAP02671 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FGAP02671 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FGAP02671 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
FGAP02671 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
FGAP02671 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FGAP02671 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
FGAP02671 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FGAP02671 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FGAP02671 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
FGAP02671 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FGAP02671 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FGAP02671 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FGAP02671 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FGAP02671 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FGAP02671 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FGAP02671 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FGAP02671 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FGAP02671 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FGAP02671 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 229.5 ms